You are hereIntro to CSB2

Intro to CSB2


轉型與更名
生物資訊是生物系統所釋放出的訊號,生物資訊學的研究重點在於如何利用這些訊息解決生物學的問題;系統生物學則利用系統釋出的訊號,推測系統的構造與運作機制。換句話說,生物資訊學與系統生物學是一體的兩面,因此教育部尖端人才培育計畫下的「生物資訊教學資源中心」已改名為「生物資訊與系統生物學教學資源中心」。隨後中心下的夥伴學校,例如國立臺灣大學也建立「系統生物與生物資訊學研究中心」, 其它大學也準備改名或設立新的單位。中央大學目前也有設立了「生物資訊與系統生物研究所」。
本校在肝炎疫苗的研發、基因體研究上均開風氣之先,為維持領導國內趨勢之傳統,擬將「生物資訊研究中心」改名為「系統與合成生物學研究中心」(Center for Systems and Synthetic Biology,簡寫為CSB2,以下簡稱為「本中心」)。這是因為系統生物學有些像是利用歸納法,協助我們找到、並整理出現存生物學的運作原理;而合成生物學則可由這些規則做演譯,並驗證找到的規則與理論是否正確。近代科學是把歸納法和演譯法結合起來而發展的,根據諾貝爾獎獲得者楊振寧博士的看法,演譯法的影響甚至高於歸納法。目前國內各校多半只看見系統生物學的重要性,卻未瞭解合成生物學的重要,因此我們希望將這兩種互補的研究方法結合在一起,發展尖端分析方法,找出生物學的規則與原理,以建立生物學的理論架構。

現有基礎
自2002年起,本校生物資訊研究中心建立之初,就已開始舉辦系統生物學研討會,邀請國外專家解釋新知。日後每年都有活動或有系統生物學方面的專家來訪,甚至舉辦國際會議。生物資訊學研究所在成立之初,即已洞悉未來的趨勢,因此網羅了對基因體工程有興趣的張傳雄老師,為發展合成生物學做伏筆。隨後又聘請物理、電機與控制背景的人才,為發展系統生物學做準備。現在物理背景的黃宣誠老師已在國際系統生物學會議中擔任學術委員,亦參與國際學會的籌備工作。他與電控背景的鍾翊方老師等,也在校內開設系統生物學、系統生物學實習等課程;生物學背景的楊永正與張傳雄老師,則分別整理生物體的運作原理,啟動合成生物學的研究。
生物資訊研究中心每學期均與生物資訊研究所合辦學術演講,至今已連續四年。2006年暑期,由本校楊永正老師又邀請國內專家,於陽明開設聯合的「系統生物學」課程,對國立臺灣大學、國立中正大學、國立中興大學三校開放同步遠距教學。2007年暑期將另有國立清華大學加入,國立成功大學也在考慮當中。本校的系統生物學教學與研究,由2002年引入新知開始,到現在已能自行開課教學。同時,老師們的研究結果,不但在國際會議中出現,也即將有研究論文在期刊發表,過去的努力將逐漸開花結果。接下來應有能力整合出合作計畫,推動更深入的研究。不過以生物資訊研究中心為基礎的這幾位老師,仍需與其它領域的老師合作,才有機會更上一層樓。

建立目的
為在本校發展尖端的系統生物學與合成生物學研究,必須整合團隊一起合作,並在未來向外申請計畫。成立中心將有助於凝聚不同領域(院、所、系)的人才,也有助於協調資源的整合與運用。例如生物資訊研究中心已有許多電腦設備,可以直接提供中心內的老師利用;中心的業務助理可以協助經常性的教師會議、計畫申請等工作。此外、2006年聘用的李國彬副研究員是高性能計算的專家,也在生物資訊學領域有優異之表現,他現在負責國家基因體醫學計畫下的「進階生物資訊核心設施」的協調工作,在未來將在中心內扮演關鍵的角色。此外,中心的學術活動將扮演教育老師、同學、與研究助理的角色。

具體目標
傳統生物學與新生物學不同之處,在於前者比較重視化約論(reductionism),不斷分解系統,希望在將子系統研究清楚後能瞭解整個系統的運作。新生物學又加入了新的研究方式,希望由系統的角度,解讀子系統間的交互作用。此外,也利用合成的方式,來驗證所找到的規則和原理是否正確。因此新生物學在未來有機會讓生物學由敘述性的科學,成為預測性的科學。因此本中心的具體目標是

1. 發展尖端研究技術,觀察新的現象
2. 利用系統生物學的方法,由現存資訊中尋找生物學中的規律與原理,並決定該如何收集更多的資訊
3. 利用基因體技術收集,所欠缺的生物資訊
4. 利用生物資訊學與系統生物學的方法,分析數據,預測出反應機制
5. 利用實驗,驗證預測,以發現規則與原理
6. 由合成的角度,驗證發現的原理是否正確